（1）1998年，国家海洋局第三海洋研究所工作任职助理研究员

（2）1999年，德国 Osnabrueck 大学生物化学系从事博士后研究工作

（3）2002年，国家海洋局第三海洋研究所工作，2003年被聘为研究员

（4）2009年-2018年，上海交通大学生命科学技术学院，特聘教授

（5）2019年-至今，上海交通大学海洋学院，特聘教授

（6）2022年-至今，上海交通大学海洋学院，副院长

主要聚焦深部生物圈，以深部生命（微生物）的生物地球化学功能为研究核心和突破点，取得一系列成果包括：（1）发现并命名一个新的古菌门——“深古菌”门(Bathyarchaeota)；同时在深古菌中发现了细菌叶绿素 a 合成酶，芳香化合物降解酶基因并验证功能，引发了对光合作用基因起源、演化的再思考，推动了对深部古菌生态/地球化学功能的研究；（2）发现深古菌是海洋中新的未知“木质素降解者”，为深入理解海洋碳循环机制和古菌功能打开了新的窗口；（3）解析了海底厌氧甲烷氧化和生物成矿的分子机制，发现了全新的烷烃代谢古菌类群，发现了新的烷烃代谢古菌和多样的电子传递途径，丰富了对海底烷烃的生物地球化学过程的认识；（4）发现深海生态系统的动态演化和丰富的代谢活动，揭示深部微生物在 N/S，Fe 等重要元素生物地球化学循环中的驱动机制。